تأسس قسم هندسة الحاسوب والمعلوماتية مع بداية تأسيس الكلية في تموز 2002 يمنح القسم شهادة البكالوريوس في تخصص هندسة الحاسوب والمعلوماتية. وكان ضمن اهداف القسم تخريج مهندسين اكفاء في تخصص الحاسوب والمعلوماتية لهم القدرة على التعامل مع التقنيات الحديثة وعلى مزاولة العمل المهني بشكل محترف.
يهدف القسم إلى إعداد مهندسين يمتلكون القابليات الآتية:
1. تصميم وعمل التجارب بالإضافة إلى تحليل وتفسير البيانات.
2. تصميم أنظمة أو أجزاء أنظمة وحسب المتطلبات.
3. له معرفة بالقضايا المعاصرة المتعلقة بهندسة الحاسوب وحل المعاضل الهندسية.
حصلت موافقة وزارة التعليم العالي والبحث العلمي على استحداث (دراسات عليا) ماجستير بتخصص هندسة الحاسوب والمعلوماتية للعام الدراسي 2012-2013.
للقسم الريادة في اكاديمية شبكات الحاسوب وتكنولوجيا المعلومات وضمن برنامج التعليم الالكتروني معتمد علميا (برنامج اكاديميات سيسكو) ، وفي الفترة الاخيرة تم اضافة برنامج شركة هواوي الصينية في مجال تكنولوجيا المعلومات والاتصالات بالتعاون والتنسيق مع وزارة التعليم والبحث العلمي