من اجل الارتقاء بمستوى جامعة نينوى لمواكبة الجامعات العالمية وبحسب توجيهات وزارة التعليم العالي والبحث العلمي تم التواصل مع عدد من الجامعات المحلية والعربية والدولية بهدف التعاون المشترك من خلال تطوير وتدريب الكادر الجامعي وتبادل الكفاءات والنشر المشترك للبحوث والاشتراك الفعال في المشاريع من خلال عقد اتفاقات تعاون مشترك مع هذه الجهات وفيما يلي ادناه قائمة بالجامعات التي تم عقد اتفاقية تعاون مشترك معها